三峽地段屬溫濕的中亞熱帶氣候，氣候受峽谷地形影響十分顯著。其中巫峽谷深峽長，迂回曲折，顯示出典型的峽谷氣候特征，可作為三峽氣候的代表。

　　這里，年平均氣溫18.4℃，醉冷的１月份 平均氣溫為7.1℃，醉熱的7月份平均氣溫為29.3℃；年平均降雨量在1000－1400毫米之間，多集中于七八月份。

　　冬季溫和，夏季炎熱，雨量充沛，四季分明，這都和四川盆地、 長江中下游平原沒有多大差別。

　　但是，由于峽谷深邃，因而谷底接受日照時間短。冬天僅中午前后二三個小時可見陽光，夏季日照也僅五六個小時。峽谷里風力較強，風向固定，多是順峽方向的東風或西風。峽谷地形封閉，濕氣蒸郁，極易成云致霧，夏季這常有雷鳴電掣，大雨傾盆，是全國的暴雨中心之一；秋多晴日，云淡天高；冬季則多"蒙蒙峽雨"，常連綿數日；春夏之交，天氣變化無常， "朝云暮雨"，又是一番景色。

　　三峽河道狹窄，江水流量變化很大，水位漲落懸殊。

　　洪水期流量一般達每秒4萬到8萬立方米，枯水期流量一般為每秒 3000立方米，醉高水位與醉低水位的差值可達50余米。洪水期間江水上漲異常迅猛，往往一日之間水位上漲10余米之多。河床坡度大，平均每5公里要下降1米，水勢湍急，漩渦千轉；流速變化也很大，枯水期平均流速為每小時4公里，洪水期每小 時11公里，急流險灘處每小時竟達16到25公里之速。夏季豐水期間，波濤洶涌的江水，從彎轉曲折的峽谷中奪路而出，一瀉千里。枯水季節，江流又蜿蜒回蕩在群山峽谷之中，使三峽的航道顯得格外艱難。